Μαθαίνοντας για τα πεπτίδια
Έρευνα, πρωτόκολλα και ενημερώσεις για πεπτίδια για επιστημονική χρήση.
-
Χημεία click στην έρευνα πεπτιδίων: κυκλοπροσθήκη αζιδίου-αλκυνίου για στοχευμένη βιοσύζευξη
Τι κάνει μια αντίδραση «χημεία click»; Η χημεία click είναι ένας συλλογικός όρος για μια κατηγορία χημικών αντιδράσεων που εξελίσσονται γρήγορα, εκλεκτικά και υπό ήπιες συνθήκες, με υψηλή απόδοση και λίγα ανεπιθύμητα...
Διάβασε περισσότερα -
Peptide mapping ερευνητικών πεπτιδίων: ενζυμική πέψη και LC-MS/MS για την επιβεβαίωση της αλληλουχίας
Ένας προσδιορισμός της μάζας του άθικτου μορίου με LC-MS επιβεβαιώνει ότι ένα ερευνητικό πεπτίδιο έχει το σωστό μοριακό βάρος, αλλά λέει λίγα για την ακριβή σειρά των αμινοξέων μέσα σε αυτό. Δύο...
Διάβασε περισσότερα -
Πράσινοι διαλύτες στην SPPS: γιατί το DMF βρίσκεται υπό πίεση και ποιες είναι οι εναλλακτικές
Το διμεθυλοφορμαμίδιο (DMF) αποτελεί εδώ και δεκαετίες τον τυπικό διαλύτη στη σύνθεση πεπτιδίων σε στερεά φάση (SPPS) με βάση το Fmoc: διογκώνει καλά τις ρητίνες πολυστυρενίου και PEG, διαλύει εύκολα τα προστατευμένα...
Διάβασε περισσότερα -
Υπολειμματικοί διαλύτες σε ερευνητικά πεπτίδια: τι αποκαλύπτει η ανάλυση GC μετά τη λυοφιλοποίηση
Μετά τη σύνθεση σε στερεά φάση, την αποκοπή, τον καθαρισμό με παρασκευαστική HPLC και τη λυοφιλοποίηση, ένα ερευνητικό πεπτίδιο σπάνια είναι εντελώς απαλλαγμένο από τις χημικές ουσίες που κατέστησαν δυνατή τη διεργασία...
Διάβασε περισσότερα -
Συρραμμένα πεπτίδια: πώς ένας υδρογονανθρακικός «συνδετήρας» βελτιώνει τη δευτεροταγή δομή και την αντίσταση στις πρωτεάσες στην έρευνα
Τα γραμμικά πεπτίδια έχουν ένα δομικό πρόβλημα: εκτός μιας αναδιπλωμένης πρωτεΐνης, οι σύντομες α-ελικοειδείς αλληλουχίες χάνουν το σχήμα τους μόλις βρεθούν σε διάλυμα. Για τους ερευνητές που θέλουν να μελετήσουν μια συγκεκριμένη...
Διάβασε περισσότερα -
Πεπτίδια επισημασμένα με σταθερά ισότοπα: εσωτερικά πρότυπα για ποσοτική LC-MS/MS
Η ποσοτική φασματομετρία μάζας παίζει διαρκώς μεγαλύτερο ρόλο στην έρευνα που σχετίζεται με πεπτίδια, από μελέτες πρωτεομικής έως τον χαρακτηρισμό συνθετικών ερευνητικών πεπτιδίων. Ένα σήμα LC-MS/MS, όμως, δεν αποτελεί από μόνο του...
Διάβασε περισσότερα -
Δισουλφιδικές γέφυρες σε ερευνητικά πεπτίδια με πολλαπλές κυστεΐνες: οξειδωτική αναδίπλωση και τοποεκλεκτικές στρατηγικές
Πολλά βιοδραστικά ερευνητικά πεπτίδια οφείλουν την τρισδιάστατη δομή τους όχι μόνο στην αλληλουχία αμινοξέων τους, αλλά και σε μία ή περισσότερες δισουλφιδικές γέφυρες μεταξύ καταλοίπων κυστεΐνης. Σε πεπτίδια με ένα μόνο ζεύγος...
Διάβασε περισσότερα -
Native Chemical Ligation: πέρα από το όριο μήκους της SPPS
Γιατί η SPPS δεν κλιμακώνεται απεριόριστα Η σύνθεση πεπτιδίων σε στερεά φάση (SPPS) είναι η τυπική μέθοδος για την κατασκευή ερευνητικών πεπτιδίων, κατάλοιπο προς κατάλοιπο, πάνω σε έναν στερεό φορέα ρητίνης. Προηγούμενα...
Διάβασε περισσότερα -
Υπολειμματικό TFA μετά την ανταλλαγή αντισταθμιστικού ιόντος: τι αποκαλύπτει η ιοντική χρωματογραφία
Γιατί το υπολειμματικό TFA έχει σημασία Το τριφθοροοξικό οξύ (TFA) είναι απαραίτητο στον προπαρασκευαστικό καθαρισμό ερευνητικών πεπτιδίων με HPLC: δρα ως αντιδραστήριο σχηματισμού ζευγών ιόντων και δίνει οξείες, καλά διαχωρισμένες κορυφές κατά...
Διάβασε περισσότερα -
Τριχοειδής ηλεκτροφόρηση ως ορθογώνια τεχνική παράλληλα με την RP-HPLC για ερευνητικά πεπτίδια
Όταν ένα ερευνητικό πεπτίδιο έχει περάσει από προπαρασκευαστικό καθαρισμό με HPLC και ανταλλαγή αντισταθμιστικού ιόντος, παραμένει ένα κρίσιμο ερώτημα: είναι πράγματι σωστό το αναφερόμενο ποσοστό καθαρότητας; Η RP-HPLC είναι το πρότυπο του...
Διάβασε περισσότερα -
Από το καθαρό κλάσμα στο τελικό προϊόν: συνένωση κλασμάτων και ανταλλαγή αντισταθμιστικού ιόντος μετά την παρασκευαστική HPLC
Η παρασκευαστική HPLC αποδίδει μια σειρά κλασμάτων, το καθένα με το δικό του προφίλ καθαρότητας. Το κλάσμα όμως που βγαίνει από τον συλλέκτη δεν είναι ακόμη τελικό προϊόν. Ανάμεσα στην «καθαρή κορυφή»...
Διάβασε περισσότερα -
Καθαρισμός ερευνητικών πεπτιδίων με παρασκευαστική HPLC: από το ακατέργαστο μείγμα στο καθαρό κλάσμα
Μετά το στάδιο της αποκοπής δεν υπάρχει στον πάγκο ένα καθαρό ερευνητικό πεπτίδιο, αλλά ένα σύνθετο ακατέργαστο μείγμα. Το προηγούμενο άρθρο αυτής της σειράς εξήγησε πώς οι δεσμευτές (scavengers) κατά την αποκοπή...
Διάβασε περισσότερα
