Wissenswertes über Peptide
Forschung, Protokolle und Neuigkeiten zu Peptiden für die wissenschaftliche Verwendung.
-
Abspaltcocktails in der Fmoc-SPPS: warum Scavenger darüber entscheiden, ob ein Forschungspeptid rein freigesetzt wird
Jede Fmoc-SPPS-Synthese endet mit einem Schritt, der die spätere Reinheit mindestens ebenso stark beeinflusst wie die Kupplungschemie selbst: der Abspaltung. In diesem Moment wird das vollständige Peptid, das nach Dutzenden Kupplungs- und...
Weiterlesen -
Capping und Deletionssequenzen in der Fmoc-SPPS: Wie eine unvollständige Kupplung die Peptidreinheit untergräbt
Bei der Synthese von Forschungspeptiden mittels Fmoc-SPPS verläuft nicht jeder Kupplungsschritt zu hundert Prozent. Ein kleiner Prozentsatz der Aminogruppen wird nicht erreicht, und ohne Eingreifen summieren sich diese unvollständigen Kupplungen zu einem...
Weiterlesen -
Harzwahl in der Fmoc-SPPS: Wang- versus Rink-Amid-Harz und die Rolle der Beladung
Beim Aufbau eines Forschungspeptids mittels Festphasenpeptidsynthese (SPPS) richtet sich die Aufmerksamkeit häufig auf die Kupplungschemie: welches Aktivierungsreagenz, welche Schutzgruppen, welches Lösungsmittel. Eine für das Endergebnis mindestens ebenso entscheidende Wahl wird dabei häufig...
Weiterlesen -
Schutzgruppen in der Fmoc-SPPS: wie Orthogonalität über den Erfolg einer Peptidsynthese entscheidet
Beim Aufbau einer Peptidkette mittels Festphasensynthese (SPPS) muss jede reaktive Seitenkette vorübergehend abgeschirmt werden, da sonst unerwünschte Nebenreaktionen zwischen Aminosäuren entstehen, die nicht miteinander gekoppelt werden sollen. Diese Abschirmung – die Schutzgruppenstrategie...
Weiterlesen -
Beschleunigte Stabilitätsstudien: Wie die Haltbarkeit von Forschungspeptiden bestimmt wird
Ein Verfallsdatum auf einem Analysenzertifikat wirkt oft wie eine feststehende Tatsache, doch hinter diesem Datum steht in der Regel ein Rechenmodell. Nur wenige Labore können es sich leisten, ein Peptid zwei Jahre...
Weiterlesen -
Kupplungsreagenzien in der Peptidsynthese: Wie HBTU und HATU Amidbindungen bilden
Bei der Synthese von Forschungspeptiden sieht die Bildung einer Amidbindung auf dem Papier einfach aus: Die Carbonsäuregruppe einer Aminosäure reagiert mit der Aminogruppe der nächsten. In der Praxis läuft diese Reaktion jedoch...
Weiterlesen -
Fluoreszenz- und Biotinmarkierung von Forschungspeptiden: Techniken und Überlegungen
Warum Forschende Peptide markieren In vielen Versuchsaufbauten genügt es nicht zu wissen, dass ein Peptid eine bestimmte Wechselwirkung eingeht – man möchte diese Wechselwirkung auch verfolgen, quantifizieren oder sichtbar machen. Dazu wird...
Weiterlesen -
Inertgasatmosphäre bei der Lagerung von Forschungspeptiden: Wie Stickstoff und Argon der Oxidation entgegenwirken
Cysteinhaltige Forschungspeptide gehören zu den oxidationsempfindlichsten Molekülen einer Peptidbibliothek. Die Thiolgruppe des Cysteins reagiert bereits mit Spuren von gelöstem Sauerstoff, und das Ergebnis ist messbar: verschobene HPLC-Peaks, eine abweichende Masse in der...
Weiterlesen -
Aggregation von Forschungspeptiden analysieren: was die Größenausschlusschromatographie zeigt
Aggregation gehört zu den am wenigsten sichtbaren, aber störendsten Phänomenen in der Peptidforschung. Eine Probe kann in Massenspektrometrie und HPLC vollkommen rein erscheinen und sich in einem Assay dennoch unerwartet verhalten, weil...
Weiterlesen -
Isoelektrischer Punkt von Forschungspeptiden: wie die Nettoladung Löslichkeit und Aggregation steuert
Wer regelmäßig mit lyophilisierten Forschungspeptiden arbeitet, kennt das Problem: Ein Peptid, das laut Zertifikat einwandfrei löslich sein sollte, trübt sich in einem bestimmten Puffer dennoch ein oder fällt nach einigen Stunden aus....
Weiterlesen -
N- und C-terminale Modifikationen von Forschungspeptiden: Acetylierung und Amidierung
Forschungspeptide werden fast immer mit einer bestimmten Sequenz bestellt, doch wer die Spezifikation genau betrachtet, findet oft auch einen Hinweis zu den Termini: freies N-terminales Amin, freie C-terminale Säure oder eine acetylierte...
Weiterlesen -
Circulardichroismus: die Sekundärstruktur von Forschungspeptiden bestimmen
Die meisten Analysentechniken, die in früheren Artikeln dieses Blogs behandelt wurden – HPLC, Massenspektrometrie, UV-Vis-Spektrophotometrie, Aminosäureanalyse –, beantworten die Frage, wie viel Peptid sich in einer Probe befindet und wie rein es...
Weiterlesen
